Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Arid4aF8VPQ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arid4aF8VPQ2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms