Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gm8444F6XS56 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm8444F6XS56 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms