Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm28305F6U473 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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