Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm21977F6U3N7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms