Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

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Length 2,391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
BC067074F6RXI4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
BC067074F6RXI4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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