Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Lmod3E9QA62 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Lmod3E9QA62 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms