Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ankrd35E9Q9D8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ankrd35E9Q9D8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms