Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Usp31E9Q6Y8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Usp31E9Q6Y8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Usp31E9Q6Y8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Usp31E9Q6Y8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms