Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Simc1E9Q6E9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Simc1E9Q6E9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms