Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BC005561E9Q5E2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BC005561E9Q5E2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BC005561E9Q5E2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BC005561E9Q5E2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BC005561E9Q5E2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BC005561E9Q5E2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BC005561E9Q5E2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms