Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pgbd1E9Q492 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pgbd1E9Q492 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms