Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cfap46E9Q2C0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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