Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrp3E9Q1T6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrp3E9Q1T6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms