Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zfp558E9Q1J0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Zfp558E9Q1J0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Zfp558E9Q1J0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Zfp558E9Q1J0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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