Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ryr1E9PZQ0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ryr1E9PZQ0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms