Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scaf11E9PZM7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scaf11E9PZM7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms