Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gcn1E9PVA8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gcn1E9PVA8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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