Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lonrf1D3YY23 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lonrf1D3YY23 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms