Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kif28pD3YXS5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kif28pD3YXS5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms