Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SafbD3YXK2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SafbD3YXK2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms