Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ube2d4D3YUH6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms