Protein–RNA interactions for Protein: C0HKE5

Hist1h2ag, Histone H2A type 1-G, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist1h2agC0HKE5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2agC0HKE5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2agC0HKE5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2agC0HKE5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2agC0HKE5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hist1h2agC0HKE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hist1h2agC0HKE5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms