Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzd8B9EJ80 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms