Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pnldc1B2RXZ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pnldc1B2RXZ1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms