Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Siah3B2RWG3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Siah3B2RWG3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms