Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BC035947B2RQY6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms