Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms