Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtpruB1AUH1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PtpruB1AUH1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PtpruB1AUH1 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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