Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930435E12RikA6X8Z9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms