Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc9bA3KGF9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc9bA3KGF9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms