Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms