Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Klhl41A2AUC9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms