Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1A2ANU3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Syndig1A2ANU3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms