Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn34dA2AGU5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn34dA2AGU5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms