Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Frmpd4A2AFR3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Frmpd4A2AFR3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms