Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Krtap29-1A2A5X4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Krtap29-1A2A5X4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms