Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms