Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms