Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Igkv9-129-201ENSMUST00000103308 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Zfp850-203ENSMUST00000180502 6163 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm11281-201ENSMUST00000141391 576 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm12582-201ENSMUST00000030555 697 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm25480-201ENSMUST00000083217 133 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm37498-201ENSMUST00000193524 4002 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm12683-201ENSMUST00000117528 415 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AC156025.1-201ENSMUST00000223597 3551 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Dnah6-204ENSMUST00000204053 12435 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm26276-201ENSMUST00000157099 109 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 1700027F06Rik-201ENSMUST00000203901 243 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm8785-201ENSMUST00000220259 487 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Iigp1-201ENSMUST00000032473 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm14861-201ENSMUST00000119451 455 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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