Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Rps12-ps19-201ENSMUST00000119773 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm26046-201ENSMUST00000157312 166 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Gm22670-201ENSMUST00000158724 143 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 9430002A10Rik-202ENSMUST00000185395 475 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 1700028D13Rik-202ENSMUST00000187272 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Gm12763-201ENSMUST00000151344 1939 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Dcn-201ENSMUST00000105287 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Spam1-201ENSMUST00000031693 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ezh1-201ENSMUST00000100417 3636 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Cypt3-202ENSMUST00000112573 669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Zfp871-201ENSMUST00000057501 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Errfi1-202ENSMUST00000073600 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ptprd-220ENSMUST00000174831 4518 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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Rnf40Q3U319 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ssbp1-202ENSMUST00000114779 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gip-202ENSMUST00000103157 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13983-201ENSMUST00000118018 865 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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