Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 AC151968.1-201ENSMUST00000214437 568 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC154467.1-201ENSMUST00000227527 449 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Wfdc15a-201ENSMUST00000063251 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Magea1-201ENSMUST00000078193 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC123705.3-201ENSMUST00000223531 2069 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Cpb2-201ENSMUST00000022576 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr479-203ENSMUST00000214599 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1493-ps1-202ENSMUST00000208667 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1305-202ENSMUST00000213405 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm8475-201ENSMUST00000118211 526 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Lgals8-208ENSMUST00000144283 1148 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm18702-201ENSMUST00000196923 588 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 AC163295.1-201ENSMUST00000227840 314 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr339-201ENSMUST00000071437 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm37875-201ENSMUST00000192101 1498 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1224-ps1-204ENSMUST00000216833 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr395-202ENSMUST00000215690 4275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Gm5796-201ENSMUST00000096184 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp4P35123 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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