Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm30849-201ENSMUST00000214503 1379 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Macf1-202ENSMUST00000084301 23398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm28190-201ENSMUST00000189766 722 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm23925-201ENSMUST00000082471 132 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AI481877-201ENSMUST00000107547 4664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm28941-201ENSMUST00000185536 1017 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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Col5a3Q9JLI2 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm21955-201ENSMUST00000194137 4968 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm13961-201ENSMUST00000119282 4772 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm14981-201ENSMUST00000117325 943 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm6625-201ENSMUST00000177870 272 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr625-ps1-202ENSMUST00000190218 927 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm35667-201ENSMUST00000199122 711 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Col5a3Q9JLI2 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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