Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn1r148-201ENSMUST00000177774 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn1r100-201ENSMUST00000177815 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm3259-205ENSMUST00000185432 1077 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm28926-201ENSMUST00000191063 680 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Trav3-2-201ENSMUST00000198999 305 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Olfr798-201ENSMUST00000079810 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm14406-202ENSMUST00000108945 1348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Kcnrg-201ENSMUST00000051184 1766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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H2-Q1O19441 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
H2-Q1O19441 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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