Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23030-201ENSMUST00000158004 273 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22857-201ENSMUST00000174969 134 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1700108J01Rik-201ENSMUST00000187423 484 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm2926-201ENSMUST00000205625 239 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC160120.1-201ENSMUST00000227446 663 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1700011H14Rik-205ENSMUST00000228936 3444 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ifi204-201ENSMUST00000111214 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a29-201ENSMUST00000113298 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC163354.1-204ENSMUST00000222226 2033 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Eps8-202ENSMUST00000100841 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm24810-201ENSMUST00000175317 70 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1700019F05Rik-201ENSMUST00000202487 533 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm45049-201ENSMUST00000207586 591 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm4587-201ENSMUST00000209135 637 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC168056.2-201ENSMUST00000223591 269 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mrgprb8-201ENSMUST00000056676 1123 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Dsg1bQ7TSF1 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Dsg1bQ7TSF1 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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Dsg1bQ7TSF1 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1505-202ENSMUST00000216623 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm16126-201ENSMUST00000126025 589 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm7094-201ENSMUST00000178379 366 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm26972-201ENSMUST00000183218 344 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm17916-202ENSMUST00000187634 1187 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Dsg1bQ7TSF1 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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