Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 AC118476.1-201ENSMUST00000216237 349 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm18120-201ENSMUST00000220079 511 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm18620-201ENSMUST00000222295 324 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 AC160114.2-201ENSMUST00000223021 300 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Sbpl-201ENSMUST00000024939 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Olfr381-201ENSMUST00000078358 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Gm24763-201ENSMUST00000083688 190 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r79-201ENSMUST00000164462 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Pias1-202ENSMUST00000214830 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Acsl4-204ENSMUST00000112907 5137 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 A230057D06Rik-201ENSMUST00000208961 3026 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm3286-203ENSMUST00000201629 1945 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Rlf-203ENSMUST00000168615 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Wdr17-202ENSMUST00000127511 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm13176-201ENSMUST00000117910 477 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm15164-201ENSMUST00000122203 271 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm13669-201ENSMUST00000122366 457 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gypc-201ENSMUST00000172434 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm29385-201ENSMUST00000186831 363 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37191-201ENSMUST00000193346 388 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm44002-201ENSMUST00000205134 594 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC154738.7-201ENSMUST00000228606 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Prss23os-201ENSMUST00000032858 334 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Ctla4-202ENSMUST00000097720 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Ubash3bQ8BGG7 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
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