Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Agr2-201ENSMUST00000020898 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC131660.1-201ENSMUST00000215630 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm7768-201ENSMUST00000222988 597 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm23734-201ENSMUST00000083753 109 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Bdnf-201ENSMUST00000053317 4266 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC159244.3-201ENSMUST00000222887 3153 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 BC064078-202ENSMUST00000131176 2299 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Lipn-201ENSMUST00000025682 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-203ENSMUST00000105424 6932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-202ENSMUST00000092420 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Clca4a-201ENSMUST00000029923 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Trpm3-204ENSMUST00000099564 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vps50-201ENSMUST00000001412 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm26417-201ENSMUST00000104274 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Ndufb5-203ENSMUST00000122290 625 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm25640-201ENSMUST00000175378 125 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm20690-201ENSMUST00000177341 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Brd8-203ENSMUST00000115765 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 CT030181.1-201ENSMUST00000089534 3549 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm14570-201ENSMUST00000119444 391 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm12535-201ENSMUST00000121025 484 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Tsr1Q5SWD9 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Tsr1Q5SWD9 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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