Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Reg3d-202ENSMUST00000167492 644 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm27348-201ENSMUST00000184511 170 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm27601-201ENSMUST00000184794 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm34078-201ENSMUST00000198202 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm43384-201ENSMUST00000200569 637 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr396-ps1-202ENSMUST00000205791 633 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm6828-201ENSMUST00000207902 1186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm4556-201ENSMUST00000217808 355 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 AC154576.2-203ENSMUST00000224736 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 AC154506.3-201ENSMUST00000225417 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Scaper-204ENSMUST00000216595 2911 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr1469-202ENSMUST00000216910 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Zfp37-207ENSMUST00000222748 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm36936-201ENSMUST00000194508 2749 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm44829-201ENSMUST00000208008 3193 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr970-203ENSMUST00000215922 1739 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm25595-201ENSMUST00000102273 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm12119-201ENSMUST00000136083 700 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm23896-201ENSMUST00000158109 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm24343-201ENSMUST00000158708 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm8837-201ENSMUST00000161037 1107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ccbe1Q3MI99 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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