Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm2916-201ENSMUST00000178392 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm10717-209ENSMUST00000179982 681 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm10410-201ENSMUST00000180138 384 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28885-201ENSMUST00000185615 563 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 2310008N11Rik-201ENSMUST00000189978 568 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 2310008N11Rik-203ENSMUST00000210732 601 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Clec2j-201ENSMUST00000032517 515 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Arhgap32-203ENSMUST00000174641 13568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Kat7-202ENSMUST00000092766 3414 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 5830444F18Rik-201ENSMUST00000194009 1992 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37186-201ENSMUST00000195629 2861 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm43317-201ENSMUST00000197924 2544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ubr4-201ENSMUST00000097822 15928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Lmbrd2-201ENSMUST00000090380 3210 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Pde4b-207ENSMUST00000106908 4304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ranbp17-201ENSMUST00000037522 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm44220-201ENSMUST00000203784 2487 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr1417-203ENSMUST00000214887 3582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm13189-201ENSMUST00000138462 252 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm22235-201ENSMUST00000157085 110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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Hoxd9P28357 Gm16269-201ENSMUST00000160532 409 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm28501-201ENSMUST00000188729 421 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm44068-201ENSMUST00000204049 2128 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC156832.1-201ENSMUST00000217609 811 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm18628-201ENSMUST00000220584 475 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC211878.1-201ENSMUST00000221668 474 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC155167.1-201ENSMUST00000228931 614 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm10139-201ENSMUST00000081471 171 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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