Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm2645-201ENSMUST00000223516 547 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Esp31-201ENSMUST00000174742 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Oog3-201ENSMUST00000050933 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5715-201ENSMUST00000196854 1465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1159-ps1-201ENSMUST00000117651 913 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm23965-201ENSMUST00000157969 142 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm17103-201ENSMUST00000168897 549 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Samd15-201ENSMUST00000169669 1194 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm34882-201ENSMUST00000193245 974 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Tas2r120-201ENSMUST00000071707 892 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
Sh3bp1P55194 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm42728-201ENSMUST00000202644 1552 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm43696-201ENSMUST00000199385 6071 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Cdh7-208ENSMUST00000146282 4776 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Prlr-212ENSMUST00000148257 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Ctla2b-202ENSMUST00000171347 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Sh3bp1P55194 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms