Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm32754-201ENSMUST00000199442 257 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44162-201ENSMUST00000203543 544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Prl4a1-201ENSMUST00000021779 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ceacam12-201ENSMUST00000032520 1056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Rpl31-ps17-201ENSMUST00000097040 378 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1311-203ENSMUST00000215321 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43025-201ENSMUST00000201764 1886 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Kcnma1-201ENSMUST00000065788 4524 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Shprh-201ENSMUST00000044053 9271 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn1r39-208ENSMUST00000228919 2105 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29438-201ENSMUST00000191298 2613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Zfp791-202ENSMUST00000211109 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm11976-201ENSMUST00000119236 295 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr713-201ENSMUST00000098139 975 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Synrg-208ENSMUST00000183714 3651 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Dnah17-202ENSMUST00000084803 14889 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC124516.3-201ENSMUST00000221302 3613 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Zgrf1-203ENSMUST00000196141 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr1087-202ENSMUST00000214141 3861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Matr3-ps2-201ENSMUST00000160839 1996 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Foxp1-204ENSMUST00000113322 7177 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Lypd6-205ENSMUST00000169232 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Gm36888-201ENSMUST00000195819 2945 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 A230108P19Rik-201ENSMUST00000151782 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC154354.1-201ENSMUST00000224585 2109 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Hoxd9P28357 Fmn1-201ENSMUST00000081349 4235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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